南京市食品药品监督检验院是根据机构改革要求，在整合市食品药品检验所和市质检院食品检验职能基础上组建的食品药品质量监督检验法定机构。主要职能为食品药品质量监管提供技术保障，承担辖区内药品、食品（生产、流通、消费环节）、食用农产品及食品添加剂、化妆品的监督检验；开展与药品、食品质量、检验等有关方面的科研工作；开展对本辖区内区级检验机构和相关企业质量检验机构的业务指导和培训工作。